聯合國大學國際軟件技術研究所

　　聯合國大學國際軟件技術研究所係根據中葡兩國政府及聯合國大學於1991年簽訂的諒解備忘錄而在澳門設立的研究機構，以協助發展中國家開發和提升應用電腦軟件研究、培訓人員、促進國際軟件技術合作為主要工作目的。

　　自1991年《中華人民共和國政府、聯合國大學、葡萄牙共和國政府和澳門總督關於聯合國大學國際軟件技術研究所建立、運行和以澳門為址的協定》生效時起，澳門基金會即為代表澳門執行該《協定》的機構，並於1999年根據《協定》向該研究所提供地厘古工程師馬路4號施利華文第士屋宇作為其固定辦公地點。

　　澳門基金會現時主要在研究所的辦公地點、人員宿舍及膳食設施上提供協助，包括租用政府房屋向該研究所人員提供住宿，並收取象徵性租金，以及每年向施利華文第士屋宇和培訓人員宿舍的維修保養提供部分資助。

　　此外，基金會亦根據《協定》，對參加者包括與澳門有關的學者和受培訓人員的特定項目，按照實際情況提供資助，例如澳門特區電子政府（e-Macao）開發項目。

　　上述的諒解備忘錄及《協定》的葡文、英文及中文版本，已於1992年8月31日《澳門政府公報》第35期內刊登。

澳門科學館股份有限公司

　　澳門科學館由時任澳門特別行政區行政長官何厚鏵先生倡議籌建，由澳門基金會於2001年10月成立相關的工作小組負責具體工作，包括確定澳門科學館的概念設計和建築設計、研究該館的運作模式等。

　　為妥善籌備澳門科學館的興建，並使該館的營運和管理正規化，澳門科學館股份有限公司於2005年6月9日成立，澳門基金會持股98%、澳門生產力暨科技轉移中心及科學技術發展基金分別持股1%。

　　作為澳門科學館股份有限公司的大股東，澳門基金會向該公司提供財政運營津貼。

　　澳門科學館股份有限公司係按照澳門特別行政區《商法典》及其他相關法律規定成立，其運作由本身的行政管理機關及監察機關確保。澳門基金會僅為持有該公司權益的機構，並非基金會屬下的技術輔助單位。

　　澳門科學館股份有限公司的工作人員按照私人勞動關係制度聘用，與公職並無聯繫，具體的人事管理事宜亦由公司本身的制度規範。公共行政工作人員的薪俸及待遇不適用於該公司的工作人員。